Nació el 11 de agosto de 1959, en el distrito de Cabanilla de la provincia de Lampa, en la región de Puno formada y educada en el seno de una familia tradicional, e hija mayor de seis hermanos. Estudió Ingeniería de Minas en la Universidad Nacional del Altiplano de Puno, y fue congresista de la República en el periodo 2006-2011.
Susana Vilca fue congresista en el periodo 2006-2011, y exviceministra de Minas (durante agosto de 2011 a enero de 2012) en la gestión del Gobierno de Ollanta Humala, regresa al Ministerio de Energía y Minas (Minem), ahora como titular del sector, en reemplazo de Juan Carlos Lui Yonsen, quien renunció por el caso de Gasoducto Sur.
Vilca Achata también ocupó el cargo de presidenta del Instituto Geológico, Minero y Metalúrgico (Ingemmet), entre 2012 y 2016, y fue directora del Instituto de Ingenieros de Minas del Perú – IIMP (2016-2018).
En el 2018 fue designada por el Consejo Directivo del Instituto de Ingenieros de Minas del Perú (IIMP) como nueva directora de la revista Minera, publicación oficial de la organización minera y los encuentros especializados que organiza, como Perumin, proExplo y los congresos internacionales de Relaciones Comunitarias y Gestión Minera.